Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP214P35658 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP214P35658 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP214P35658 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP214P35658 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP214P35658 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP214P35658 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP214P35658 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP214P35658 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP214P35658 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP214P35658 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP214P35658 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP214P35658 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP214P35658 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP214P35658 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP214P35658 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP214P35658 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP214P35658 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP214P35658 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP214P35658 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP214P35658 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NUP214P35658 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP214P35658 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP214P35658 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP214P35658 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP214P35658 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP214P35658 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP214P35658 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP214P35658 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP214P35658 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP214P35658 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP214P35658 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP214P35658 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP214P35658 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP214P35658 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP214P35658 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP214P35658 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP214P35658 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP214P35658 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP214P35658 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP214P35658 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP214P35658 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP214P35658 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP214P35658 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP214P35658 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP214P35658 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP214P35658 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP214P35658 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP214P35658 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP214P35658 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP214P35658 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP214P35658 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP214P35658 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP214P35658 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP214P35658 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP214P35658 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP214P35658 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP214P35658 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP214P35658 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP214P35658 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP214P35658 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP214P35658 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP214P35658 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP214P35658 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP214P35658 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP214P35658 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP214P35658 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP214P35658 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP214P35658 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP214P35658 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP214P35658 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP214P35658 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP214P35658 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP214P35658 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP214P35658 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP214P35658 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP214P35658 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP214P35658 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP214P35658 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP214P35658 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP214P35658 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP214P35658 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP214P35658 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP214P35658 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP214P35658 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP214P35658 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP214P35658 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP214P35658 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP214P35658 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP214P35658 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP214P35658 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP214P35658 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP214P35658 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP214P35658 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP214P35658 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP214P35658 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP214P35658 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP214P35658 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP214P35658 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP214P35658 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms