Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MATN1P21941 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MATN1P21941 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MATN1P21941 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MATN1P21941 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MATN1P21941 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MATN1P21941 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MATN1P21941 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MATN1P21941 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MATN1P21941 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MATN1P21941 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MATN1P21941 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MATN1P21941 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MATN1P21941 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MATN1P21941 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MATN1P21941 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MATN1P21941 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MATN1P21941 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MATN1P21941 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MATN1P21941 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MATN1P21941 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MATN1P21941 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MATN1P21941 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MATN1P21941 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MATN1P21941 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MATN1P21941 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MATN1P21941 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MATN1P21941 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MATN1P21941 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MATN1P21941 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MATN1P21941 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MATN1P21941 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MATN1P21941 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MATN1P21941 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MATN1P21941 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MATN1P21941 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN1P21941 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN1P21941 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN1P21941 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN1P21941 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN1P21941 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN1P21941 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN1P21941 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN1P21941 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN1P21941 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN1P21941 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN1P21941 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN1P21941 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN1P21941 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN1P21941 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN1P21941 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN1P21941 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN1P21941 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN1P21941 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN1P21941 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN1P21941 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN1P21941 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN1P21941 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN1P21941 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN1P21941 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN1P21941 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN1P21941 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN1P21941 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN1P21941 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN1P21941 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN1P21941 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MATN1P21941 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN1P21941 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN1P21941 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN1P21941 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN1P21941 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN1P21941 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN1P21941 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN1P21941 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN1P21941 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN1P21941 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN1P21941 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN1P21941 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN1P21941 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN1P21941 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN1P21941 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN1P21941 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN1P21941 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN1P21941 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN1P21941 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN1P21941 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN1P21941 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN1P21941 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN1P21941 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN1P21941 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN1P21941 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN1P21941 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN1P21941 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN1P21941 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN1P21941 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN1P21941 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN1P21941 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN1P21941 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN1P21941 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN1P21941 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms