Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE6AP16499 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE6AP16499 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE6AP16499 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE6AP16499 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE6AP16499 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE6AP16499 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE6AP16499 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDE6AP16499 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDE6AP16499 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE6AP16499 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PDE6AP16499 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE6AP16499 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE6AP16499 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDE6AP16499 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE6AP16499 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE6AP16499 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE6AP16499 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE6AP16499 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE6AP16499 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE6AP16499 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE6AP16499 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE6AP16499 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE6AP16499 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE6AP16499 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE6AP16499 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE6AP16499 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE6AP16499 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE6AP16499 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDE6AP16499 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDE6AP16499 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDE6AP16499 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE6AP16499 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE6AP16499 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE6AP16499 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE6AP16499 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms