Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2F2P13984 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2F2P13984 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2F2P13984 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2F2P13984 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2F2P13984 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2F2P13984 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2F2P13984 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2F2P13984 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2F2P13984 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2F2P13984 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2F2P13984 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms