Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HARSP12081 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HARSP12081 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HARSP12081 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HARSP12081 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HARSP12081 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HARSP12081 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HARSP12081 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HARSP12081 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HARSP12081 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HARSP12081 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HARSP12081 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HARSP12081 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HARSP12081 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HARSP12081 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HARSP12081 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HARSP12081 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HARSP12081 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HARSP12081 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HARSP12081 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HARSP12081 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HARSP12081 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HARSP12081 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HARSP12081 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HARSP12081 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HARSP12081 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
HARSP12081 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HARSP12081 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HARSP12081 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HARSP12081 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HARSP12081 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HARSP12081 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HARSP12081 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HARSP12081 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HARSP12081 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HARSP12081 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HARSP12081 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HARSP12081 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HARSP12081 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HARSP12081 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HARSP12081 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HARSP12081 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HARSP12081 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HARSP12081 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HARSP12081 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HARSP12081 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HARSP12081 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HARSP12081 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HARSP12081 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HARSP12081 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HARSP12081 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HARSP12081 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HARSP12081 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HARSP12081 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HARSP12081 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HARSP12081 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HARSP12081 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HARSP12081 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HARSP12081 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HARSP12081 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HARSP12081 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HARSP12081 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HARSP12081 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HARSP12081 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HARSP12081 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HARSP12081 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HARSP12081 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HARSP12081 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HARSP12081 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HARSP12081 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HARSP12081 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HARSP12081 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HARSP12081 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HARSP12081 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HARSP12081 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HARSP12081 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HARSP12081 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HARSP12081 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HARSP12081 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HARSP12081 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HARSP12081 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HARSP12081 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HARSP12081 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HARSP12081 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HARSP12081 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HARSP12081 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HARSP12081 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HARSP12081 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HARSP12081 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HARSP12081 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HARSP12081 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HARSP12081 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HARSP12081 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HARSP12081 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HARSP12081 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HARSP12081 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HARSP12081 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HARSP12081 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HARSP12081 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HARSP12081 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms