Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
LAMC1P11047 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
LAMC1P11047 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
LAMC1P11047 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
LAMC1P11047 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms