Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms