Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01878 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01878 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01878 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01878 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01878 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01878 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01878 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01878 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01878 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01878 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01878 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01878 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01878 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01878 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01878 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01878 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01878 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01878 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01878 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01878 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01878 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01878 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
P01878 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01878 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01878 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
P01878 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01878 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01878 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
P01878 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01878 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01878 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01878 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01878 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01878 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01878 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01878 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01878 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01878 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01878 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01878 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
P01878 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01878 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01878 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01878 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01878 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01878 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01878 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01878 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
P01878 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
P01878 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P01878 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P01878 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P01878 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P01878 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01878 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01878 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01878 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01878 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01878 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01878 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01878 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01878 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01878 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
P01878 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
P01878 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01878 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01878 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01878 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01878 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01878 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
P01878 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
P01878 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01878 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01878 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01878 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01878 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01878 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01878 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01878 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01878 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01878 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01878 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01878 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01878 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01878 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01878 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01878 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
P01878 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01878 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01878 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01878 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01878 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01878 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01878 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01878 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01878 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01878 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01878 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01878 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms