Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MBD4O95243 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
MBD4O95243 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD4O95243 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD4O95243 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD4O95243 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD4O95243 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD4O95243 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD4O95243 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD4O95243 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD4O95243 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD4O95243 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD4O95243 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD4O95243 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD4O95243 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD4O95243 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD4O95243 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD4O95243 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD4O95243 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD4O95243 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD4O95243 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD4O95243 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD4O95243 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD4O95243 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MBD4O95243 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MBD4O95243 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MBD4O95243 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MBD4O95243 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MBD4O95243 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MBD4O95243 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MBD4O95243 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MBD4O95243 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MBD4O95243 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MBD4O95243 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
MBD4O95243 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MBD4O95243 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MBD4O95243 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MBD4O95243 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
MBD4O95243 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MBD4O95243 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
MBD4O95243 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MBD4O95243 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MBD4O95243 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MBD4O95243 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MBD4O95243 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MBD4O95243 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MBD4O95243 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MBD4O95243 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD4O95243 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD4O95243 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD4O95243 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD4O95243 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MBD4O95243 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD4O95243 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD4O95243 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD4O95243 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD4O95243 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MBD4O95243 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD4O95243 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD4O95243 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MBD4O95243 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD4O95243 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MBD4O95243 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
MBD4O95243 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MBD4O95243 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD4O95243 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MBD4O95243 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD4O95243 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD4O95243 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MBD4O95243 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MBD4O95243 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD4O95243 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD4O95243 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD4O95243 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MBD4O95243 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD4O95243 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD4O95243 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD4O95243 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD4O95243 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MBD4O95243 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD4O95243 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD4O95243 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MBD4O95243 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD4O95243 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD4O95243 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD4O95243 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD4O95243 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD4O95243 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD4O95243 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD4O95243 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MBD4O95243 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD4O95243 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD4O95243 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD4O95243 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD4O95243 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD4O95243 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
MBD4O95243 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MBD4O95243 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
MBD4O95243 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MBD4O95243 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms