Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cops6O88545 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cops6O88545 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cops6O88545 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cops6O88545 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cops6O88545 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cops6O88545 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cops6O88545 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cops6O88545 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cops6O88545 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cops6O88545 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cops6O88545 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cops6O88545 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cops6O88545 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cops6O88545 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cops6O88545 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cops6O88545 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cops6O88545 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cops6O88545 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cops6O88545 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cops6O88545 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cops6O88545 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cops6O88545 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cops6O88545 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cops6O88545 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cops6O88545 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cops6O88545 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cops6O88545 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cops6O88545 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cops6O88545 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cops6O88545 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cops6O88545 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cops6O88545 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cops6O88545 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cops6O88545 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cops6O88545 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cops6O88545 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cops6O88545 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cops6O88545 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cops6O88545 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cops6O88545 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cops6O88545 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cops6O88545 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cops6O88545 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cops6O88545 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cops6O88545 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cops6O88545 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms