Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BNIP3LO60238 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BNIP3LO60238 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNIP3LO60238 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms