Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF13O43567 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF13O43567 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF13O43567 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF13O43567 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF13O43567 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF13O43567 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF13O43567 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF13O43567 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF13O43567 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF13O43567 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF13O43567 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF13O43567 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF13O43567 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF13O43567 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF13O43567 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF13O43567 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF13O43567 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF13O43567 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF13O43567 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF13O43567 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF13O43567 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF13O43567 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF13O43567 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF13O43567 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF13O43567 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF13O43567 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF13O43567 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF13O43567 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF13O43567 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF13O43567 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF13O43567 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF13O43567 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF13O43567 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF13O43567 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF13O43567 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RNF13O43567 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF13O43567 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF13O43567 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF13O43567 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF13O43567 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF13O43567 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF13O43567 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF13O43567 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF13O43567 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF13O43567 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF13O43567 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF13O43567 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF13O43567 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF13O43567 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF13O43567 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF13O43567 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF13O43567 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF13O43567 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF13O43567 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF13O43567 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF13O43567 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF13O43567 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF13O43567 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF13O43567 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF13O43567 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF13O43567 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF13O43567 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF13O43567 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF13O43567 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF13O43567 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF13O43567 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF13O43567 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF13O43567 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF13O43567 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF13O43567 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF13O43567 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF13O43567 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF13O43567 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF13O43567 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF13O43567 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF13O43567 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF13O43567 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF13O43567 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF13O43567 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF13O43567 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF13O43567 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF13O43567 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF13O43567 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF13O43567 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF13O43567 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF13O43567 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF13O43567 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF13O43567 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF13O43567 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF13O43567 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF13O43567 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF13O43567 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF13O43567 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF13O43567 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF13O43567 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF13O43567 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF13O43567 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF13O43567 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF13O43567 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms