Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC11O43248 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC11O43248 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC11O43248 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms