Protein–RNA interactions for Protein: O00186

STXBP3, Syntaxin-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STXBP3O00186 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
STXBP3O00186 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
STXBP3O00186 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
STXBP3O00186 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STXBP3O00186 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms