Protein–RNA interactions for Protein: F6T2D2

Gm21994, Predicted gene 21994, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21994F6T2D2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18,14■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18,14■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18,13■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18,13■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18,12■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18,11■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18,11■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,1■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18,1■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18,1■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,09■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18,09■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,09■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Gm21994F6T2D2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18,07■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18,06■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18,06■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,04■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,04■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18,02■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18,02■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18,02■□□□□ 0,48
Gm21994F6T2D2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18,01■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17,99■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17,98■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,98■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17,98■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17,97■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17,97■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,97■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Gm21994F6T2D2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17,95■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,95■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,94■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,94■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17,93■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17,92■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17,91■□□□□ 0,46
Gm21994F6T2D2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms