Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm6133B2RY53 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm6133B2RY53 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm6133B2RY53 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm6133B2RY53 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm6133B2RY53 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm6133B2RY53 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm6133B2RY53 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm6133B2RY53 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms