Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scml2B1AVB3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scml2B1AVB3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scml2B1AVB3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scml2B1AVB3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scml2B1AVB3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scml2B1AVB3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Scml2B1AVB3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scml2B1AVB3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scml2B1AVB3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scml2B1AVB3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scml2B1AVB3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scml2B1AVB3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scml2B1AVB3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scml2B1AVB3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms