Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTLL13PA6NNM8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTLL13PA6NNM8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTLL13PA6NNM8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL13PA6NNM8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL13PA6NNM8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTLL13PA6NNM8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTLL13PA6NNM8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TTLL13PA6NNM8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTLL13PA6NNM8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTLL13PA6NNM8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTLL13PA6NNM8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TTLL13PA6NNM8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTLL13PA6NNM8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTLL13PA6NNM8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TTLL13PA6NNM8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTLL13PA6NNM8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TTLL13PA6NNM8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TTLL13PA6NNM8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTLL13PA6NNM8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TTLL13PA6NNM8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTLL13PA6NNM8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms