Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP5A6NIR3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP5A6NIR3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms