Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC61Q9Y6R9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC61Q9Y6R9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms