Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms