Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLF2Q9Y5W3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF2Q9Y5W3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms