Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms