Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FARSAQ9Y285 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FARSAQ9Y285 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FARSAQ9Y285 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FARSAQ9Y285 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FARSAQ9Y285 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FARSAQ9Y285 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FARSAQ9Y285 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FARSAQ9Y285 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FARSAQ9Y285 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FARSAQ9Y285 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FARSAQ9Y285 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FARSAQ9Y285 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FARSAQ9Y285 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FARSAQ9Y285 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FARSAQ9Y285 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FARSAQ9Y285 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms