Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVW-1Q9UQF0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms