Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN2Q9UNF0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN2Q9UNF0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms