Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms