Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNIKQ9UKE5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNIKQ9UKE5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms