Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSKSQ9UJT2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms