Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MLH3Q9UHC1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms