Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCF2Q9UG63 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms