Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms