Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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