Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms