Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms