Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MBD5Q9P267 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MBD5Q9P267 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MBD5Q9P267 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MBD5Q9P267 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MBD5Q9P267 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MBD5Q9P267 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MBD5Q9P267 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MBD5Q9P267 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MBD5Q9P267 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MBD5Q9P267 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MBD5Q9P267 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MBD5Q9P267 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MBD5Q9P267 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MBD5Q9P267 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MBD5Q9P267 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MBD5Q9P267 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MBD5Q9P267 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MBD5Q9P267 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MBD5Q9P267 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MBD5Q9P267 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MBD5Q9P267 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MBD5Q9P267 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MBD5Q9P267 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MBD5Q9P267 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MBD5Q9P267 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MBD5Q9P267 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MBD5Q9P267 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MBD5Q9P267 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MBD5Q9P267 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MBD5Q9P267 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MBD5Q9P267 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MBD5Q9P267 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MBD5Q9P267 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MBD5Q9P267 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MBD5Q9P267 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MBD5Q9P267 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MBD5Q9P267 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MBD5Q9P267 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MBD5Q9P267 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MBD5Q9P267 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MBD5Q9P267 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MBD5Q9P267 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MBD5Q9P267 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MBD5Q9P267 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MBD5Q9P267 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MBD5Q9P267 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MBD5Q9P267 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MBD5Q9P267 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MBD5Q9P267 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MBD5Q9P267 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MBD5Q9P267 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MBD5Q9P267 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MBD5Q9P267 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MBD5Q9P267 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MBD5Q9P267 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MBD5Q9P267 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MBD5Q9P267 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MBD5Q9P267 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MBD5Q9P267 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MBD5Q9P267 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
MBD5Q9P267 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MBD5Q9P267 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
MBD5Q9P267 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.51■■■□□ 2
MBD5Q9P267 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
MBD5Q9P267 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD5Q9P267 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms