Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMG20BQ9P0W2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms