Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM3

ITSN2, Intersectin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN2Q9NZM3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN2Q9NZM3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN2Q9NZM3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms