Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms