Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX00

TMEM160, Transmembrane protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM160Q9NX00 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM160Q9NX00 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms