Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TBCCD1Q9NVR7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms