Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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