Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms