Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms