Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP4Q9NRJ4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP4Q9NRJ4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms