Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms