Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE7BQ9NP56 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms