Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A3Q9HC58 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms