Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP1Q9C000 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms