Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPF3BQ9BZI7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms